A melhoria da qualidade do ensino constitui um dos principais desafios do Governo e a valorização profissional dos docentes, nomeadamente através da formação contínua, uma medida considerada prioritária.

A Faculdade de Teologia, enquanto única Instituição do Ensino Superior que profissionaliza docentes na área da Educação Moral e Religiosa Católica e como entidade formadora creditada pelo Conselho Científico-Pedagógico de Formação Contínua, sente que é sua missão fomentar a formação contínua de professores, tendo em vista a aquisição das competências científicas, pedagógicas e organizacionais pretendidas pelas políticas orientadoras da oferta educativa.

Quase sempre em colaboração com o Secretariado Nacional da Educação Cristã,  com os Secretariados Diocesanos do Ensino Religioso e Centros de Formação, a Faculdade, oferece anualmente ações de formação não só no âmbito da Teologia mas também de algumas ciências afins como a História, a Filosofia, as Ciências Sociais, a Psicopedagogia, entre outras.